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《第三軍醫(yī)大學學報》創(chuàng)刊于1979年，國內(nèi)外公開發(fā)行。主要報道醫(yī)藥領域的新理論、新經(jīng)驗、新技術和新方法。
《第三軍醫(yī)大學學報》欄目設有：專家論壇、基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、軍事醫(yī)學、預防醫(yī)學、高原醫(yī)學、綜述、科研簡報、技術方法、經(jīng)驗交流和個案與短篇報道。
《第三軍醫(yī)大學學報》主要讀者對象：為醫(yī)藥學領域的中高級科研、醫(yī)療人員和高等醫(yī)藥院校的師生。
《第三軍醫(yī)大學學報》曾獲得第二、三屆國家期刊獎百種重點期刊，是中國綜合性醫(yī)藥衛(wèi)生類核心期刊、中國科技論文統(tǒng)計源期刊、中國科學引文數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計源期刊。被國內(nèi)所有數(shù)據(jù)庫和文摘雜志以及美國《化學文摘》(CA)、俄羅斯《文摘雜志》(Pж)作為源期刊收錄。是中國被引頻次最高的500種科技期刊。
